Protterは、プロテオフォームの視覚化と、注釈付きおよび予測された配列特徴を実験的なプロテオミクスの証拠と統合するオープンソースツールです。
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- DockやタスクバーからProtterを直接起動できます。
- ブラウザのタブから切り離した専用ウインドウで、気を散らさずに作業できます。
- 複数のProtterアカウントを管理し、ログアウトせずに切り替えられます。
プロテオミクス研究者やタンパク質生物学者にとって、Protterはタンパク質配列の注釈と実験的証拠を、わかりやすいトポロジー図で関連付けるのに役立ちます。UniProtアクセッションまたはタンパク質配列を入力するか、対応するプロテオミクス結果ファイルを読み込むと、同定されたペプチドや翻訳後修飾をタンパク質上にマッピングできます。Protterは、これらのデータを膜貫通領域などのキュレーション済みまたは予測された特徴と組み合わせ、トポロジーや表示スタイルをインタラクティブに調整できるようにします。個々のタンパク質の調査、データセット間での証拠の比較、出版品質の図の作成に利用できます。複数のタンパク質を含む場合も、可視化結果をエクスポートできます。
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