NCBI BLAST

NCBI BLAST は、DNA、RNA、タンパク質などの生物学的配列間の類似性を特定するために設計された強力なバイオインフォマティクス ツールです。クエリ配列を広範なデータベースと比較して相同配列を見つけ、機能的および進化的関係の推論に役立ちます。このツールは、ヌクレオチド BLAST、タンパク質 BLAST、および比較前にヌクレオチド配列をタンパク質配列に翻訳する BLASTx などのさまざまなバージョンを提供します。

NCBI BLAST の主な機能には、NCBI ヌクレオチドおよびタンパク質のデータベースなどの複数のデータベースを検索する機能と、生物または配列の特徴によって検索を制限する機能が含まれます。ユーザーは、FASTA 形式で配列を入力することも、クエリにアクセッション番号を使用することもできます。このツールは、位置固有のスコアリング マトリックスを構築して検索を絞り込む PSI-BLAST などの高度な機能もサポートしています。

NCBI BLAST は、遺伝子同定、系統解析、配列相同性の理解などのタスクのために、分子生物学および生物情報学で広く使用されています。その堅牢な機能により、生物学的配列を分析して理解しようとしている研究者にとって不可欠なリソースとなっています。