Protter es una herramienta de código abierto para visualizar proteoformas e integrar características de secuencias junto con evidencia proteómica experimental.

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Para investigadores en proteómica y biólogos especializados en proteínas, Protter ayuda a relacionar las anotaciones de secuencias proteicas con la evidencia experimental en un diagrama topológico claro. Introduzca un número de acceso de UniProt o una secuencia proteica, o cargue archivos de resultados proteómicos compatibles para representar en las proteínas los péptidos identificados y las modificaciones postraduccionales. Protter combina estos datos con características seleccionadas o predichas, como las regiones transmembrana, y permite ajustar interactivamente la topología y el estilo visual. Úselo para examinar proteínas individuales, comparar evidencias entre conjuntos de datos o preparar diagramas con calidad de publicación; las visualizaciones se pueden exportar, incluso para varias proteínas.

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