NCBI BLAST

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NCBI BLAST es una herramienta que encuentra similitudes entre secuencias biológicas, comparando secuencias de ADN o proteínas con bases de datos.

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NCBI BLAST es una poderosa herramienta bioinformática diseñada para identificar similitudes entre secuencias biológicas, como ADN, ARN y proteínas. Compara secuencias de consulta con extensas bases de datos para encontrar secuencias homólogas, ayudando en la inferencia de relaciones funcionales y evolutivas. La herramienta ofrece varias versiones, incluidas la explosión de nucleótidos, la explosión de proteínas y BLASTX, que traduce secuencias de nucleótidos a secuencias de proteínas antes de la comparación.

Las características clave de la explosión NCBI incluyen la capacidad de buscar en múltiples bases de datos, como las bases de datos de nucleótidos y proteínas NCBI, y limitar las búsquedas por organismo o características de secuencia. Los usuarios pueden ingresar secuencias en formato FASTA o usar números de acceso para consultas. La herramienta también admite funciones avanzadas como PSI-BLAST, que construye una matriz de puntuación específica de posición para refinar las búsquedas.

La explosión NCBI se usa ampliamente en biología molecular y bioinformática para tareas como la identificación de genes, el análisis filogenético y la homología de la secuencia de comprensión. Sus capacidades robustas lo convierten en un recurso esencial para los investigadores que buscan analizar y comprender las secuencias biológicas.

Herramienta básica de búsqueda de alineación local BLAST encuentra regiones de similitud entre secuencias biológicas. El programa compara secuencias de nucleótidos o proteínas con bases de datos de secuencias y calcula la significancia estadística.

Sitio web: blast.ncbi.nlm.nih.gov

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