Protter是一个开源工具,用于可视化蛋白形式,集成注释和预测的序列特征,以及实验蛋白质组学证据。
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对于蛋白质组学研究人员和蛋白质生物学家,Protter 可通过清晰的拓扑图,帮助将蛋白质序列注释与实验依据联系起来。输入 UniProt 登录号或蛋白质序列,或加载受支持的蛋白质组学结果文件,即可将鉴定出的肽段和翻译后修饰映射到蛋白质上。Protter 会将这些数据与经过整理或预测的特征(如跨膜区)结合,并支持交互式调整拓扑结构和视觉样式。您可以使用它检查单个蛋白质、比较不同数据集中的证据,或制作适用于出版物的高质量图表;可导出可视化结果,也支持一次导出多个蛋白质的图表。
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