NCBI BLAST

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NCBI BLAST是一种生物信息学工具,用于比较生物序列,识别相似性并推断功能与进化关系。
基本局部对齐搜索工具 BLAST 发现生物序列之间的相似区域。该程序将核苷酸或蛋白质序列与序列数据库进行比较并计算统计显着性。

NCBI BLAST是一种强大的生物信息学工具,旨在识别生物学序列(例如DNA,RNA和蛋白质)之间的相似性。它比较了查询序列与广泛的数据库,以找到同源序列,从而有助于推理功能和进化关系。该工具提供了各种版本,包括核苷酸爆炸,蛋白质BLAST和BLASTX,它们在比较之前将核苷酸序列转化为蛋白质序列。

NCBI BLAST的关键特征包括搜索多个数据库(例如NCBI核苷酸和蛋白质数据库)的能力,并限制了通过生物体或序列特征进行搜索。用户可以以FASTA格式输入序列,也可以使用登录号进行查询。该工具还支持高级功能,例如PSI-Blast,该功能构建了特定位置的评分矩阵来完善搜索。

NCBI BLAST广泛用于分子生物学和生物信息学用于基因鉴定,系统发育分析和理解序列同源性等任务。它的强大功能使其成为寻求分析和理解生物学序列的研究人员的重要资源。

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