NCBI BLAST

NCBI BLAST הוא כלי ביואינפורמטיקה רב עוצמה שנועד לזהות קווי דמיון בין רצפים ביולוגיים, כגון DNA, RNA וחלבונים. הוא משווה רצפי שאילתות מול מסדי נתונים נרחבים כדי למצוא רצפים הומולוגיים, ומסייע בהסקת קשרים פונקציונליים ואבולוציוניים. הכלי מציע גרסאות שונות, כולל נוקלאוטיד BLAST, Protein BLAST ו-BLASTx, שמתרגם רצפי נוקלאוטידים לרצפי חלבון לפני השוואה.

תכונות מפתח של NCBI BLAST כוללות את היכולת לחפש מול מסדי נתונים מרובים, כגון מסדי נתונים של נוקלאוטידים וחלבונים של NCBI, ולהגביל חיפושים לפי מאפייני אורגניזם או רצף. משתמשים יכולים להזין רצפים בפורמט FASTA או להשתמש במספרי גישה לשאילתות. הכלי תומך גם בתכונות מתקדמות כמו PSI-BLAST, שבונה מטריצת ניקוד ספציפית למיקום כדי לצמצם חיפושים.

NCBI BLAST נמצא בשימוש נרחב בביולוגיה מולקולרית וביואינפורמטיקה עבור משימות כגון זיהוי גנים, ניתוח פילוגנטי והבנת הומולוגיה של רצף. היכולות החזקות שלו הופכות אותו למשאב חיוני עבור חוקרים המבקשים לנתח ולהבין רצפים ביולוגיים.