Tamarind Bio è un'app che offre strumenti di biologia computazionale per la progettazione e simulazione di molecole, utilizzando modelli ML come AlphaFold.

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Tamarind è pensato per biologi computazionali, ingegneri delle proteine e gruppi di ricerca che devono eseguire flussi di lavoro di modellazione molecolare senza configurare e gestire un proprio ambiente di calcolo ad alte prestazioni. Tramite un’interfaccia web o un’API, gli utenti possono inviare lavori agli strumenti di biologia computazionale disponibili e avviare flussi di lavoro su larga scala. Usa Tamarind per prevedere la struttura delle proteine a partire dalle sequenze, progettare o ottimizzare proteine e leganti come anticorpi e nanocorpi, modellare le interazioni molecolari ed eseguire il docking di proteine o piccole molecole. Gli strumenti possono anche aiutare a valutare proprietà come la solubilità e la termo­stabilità. I ricercatori possono eseguire singole analisi, elaborare gruppi di input oppure collegare strumenti compatibili in pipeline articolate in più fasi.

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