NCBI BLAST

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NCBI BLAST è uno strumento che confronta sequenze biologiche con database per trovare somiglianze e calcolare la significatività statistica.

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NCBI BLAST è un potente strumento bioinformatico progettato per identificare somiglianze tra sequenze biologiche, come DNA, RNA e proteine. Confronta sequenze di query con ampi database per trovare sequenze omologhe, aiutando l'inferenza di relazioni funzionali ed evolutive. Lo strumento offre varie versioni, tra cui esplosione nucleotidica, esplosione proteica e BLASTX, che traduce sequenze nucleotidiche in sequenze proteiche prima del confronto.

Le caratteristiche chiave di NCBI BLAST includono la possibilità di cercare più database, come i database nucleotidici NCBI e le proteine e di limitare le ricerche per organismo o caratteristiche di sequenza. Gli utenti possono inserire sequenze in formato FASTA o utilizzare i numeri di adesione per le query. Lo strumento supporta anche funzionalità avanzate come Psi-Blast, che crea una matrice di punteggio specifica per perfezionare le ricerche.

L'esplosione NCBI è ampiamente utilizzata nella biologia molecolare e nella bioinformatica per compiti come l'identificazione genica, l'analisi filogenetica e la comprensione dell'omologia della sequenza. Le sue solide capacità lo rendono una risorsa essenziale per i ricercatori che cercano di analizzare e comprendere le sequenze biologiche.

Questa descrizione è stata generata dall'IA (intelligenza artificiale). L'IA può commettere errori. Controlla le informazioni importanti.

Strumento di ricerca di allineamento locale di base BLAST trova regioni di somiglianza tra sequenze biologiche. Il programma confronta sequenze di nucleotidi o proteine con database di sequenze e calcola la significatività statistica.

Sito web: blast.ncbi.nlm.nih.gov

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