NCBI BLAST

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NCBI BLAST è un potente strumento bioinformatico progettato per identificare somiglianze tra sequenze biologiche, come DNA, RNA e proteine. Confronta sequenze di query con ampi database per trovare sequenze omologhe, aiutando a dedurre relazioni funzionali ed evolutive. Lo strumento offre varie versioni, tra cui nucleotide BLAST, Protein BLAST e BLASTx, che traduce le sequenze nucleotidiche in sequenze proteiche prima del confronto.

Le caratteristiche principali di NCBI BLAST includono la capacità di effettuare ricerche in più database, come i database di nucleotidi e proteine ​​dell'NCBI, e di limitare le ricerche in base alle caratteristiche dell'organismo o della sequenza. Gli utenti possono inserire sequenze in formato FASTA o utilizzare numeri di accesso per le query. Lo strumento supporta anche funzionalità avanzate come PSI-BLAST, che crea una matrice di punteggio specifica per posizione per perfezionare le ricerche.

NCBI BLAST è ampiamente utilizzato in biologia molecolare e bioinformatica per attività quali l'identificazione dei geni, l'analisi filogenetica e la comprensione dell'omologia delle sequenze. Le sue robuste capacità lo rendono una risorsa essenziale per i ricercatori che cercano di analizzare e comprendere sequenze biologiche.

Strumento di ricerca di allineamento locale di base BLAST trova regioni di somiglianza tra sequenze biologiche. Il programma confronta sequenze di nucleotidi o proteine ​​con database di sequenze e calcola la significatività statistica.

Sito web: blast.ncbi.nlm.nih.gov

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