Phần mềm ứng dụng email cho phép người dùng quản lý tài khoản email của họ thông qua ứng dụng trên máy tính để bàn. Mặc dù chúng hoạt động tương tự như trình quản lý webmail có sẵn thông qua trình duyệt, nhưng ứng dụng email khách được truy cập thông qua chương trình đã tải xuống. Một số nhà cung cấp tài khoản email cung cấp ứng dụng email khách của riêng họ, mặc dù hầu hết không tự cung cấp tài khoản email. Ưu điểm chính của ứng dụng email là khả năng tạo hộp thư đến hợp nhất cho nhiều tài khoản email. Mặc dù một số dịch vụ webmail có thể hợp nhất email từ nhiều tài khoản từ cùng một nhà cung cấp, nhưng ứng dụng email khách có thể thu thập email từ các nhà cung cấp khác nhau vào một vị trí. Giống như dịch vụ webmail, ứng dụng email bao gồm các tính năng lịch hoặc tích hợp với phần mềm lịch bên ngoài, cho phép người dùng dễ dàng điều phối các cuộc họp và theo dõi các ngày quan trọng.