Kâr amacı gütmeyen kuruluşlar, bağışçılar, gönüllüler ve üyeler gibi bileşenlerle ilişkileri yönetmek için özel olarak tasarlanmış CRM yazılımını kullanır. Bu yazılım, kuruluşu finansal olarak veya gönüllü çabalarla desteklemeye istekli kişileri cezbetmeye ve elde tutmaya yardımcı olur. Tipik olarak sosyal yardım, pazarlama, halkla ilişkiler veya bağış toplamayla ilgilenen kar amacı gütmeyen personel bu araçları kullanır. Yöneticiler, pazarlama stratejilerinin etkinliğini değerlendirmek ve üyelerin etkinlikler ve bağış toplama çabaları da dahil olmak üzere çeşitli faaliyetlere katılımını ölçmek için kar amacı gütmeyen CRM'den yararlanır. Ayrıca bu yazılım, bağışları izlemek için genellikle muhasebe ve ödeme çözümleriyle entegre olur. CRM'nin hibe yönetimi veya bağış toplama platformları gibi diğer kar amacı gütmeyen araçlarla bağlantı kurması da çok önemlidir. CRM'de satış ve pazarlama fonksiyonları yer almıyorsa ek çözümlerle entegrasyon gerekebilir.