Oprogramowanie do przechowywania plików w chmurze umożliwia przechowywanie nieustrukturyzowanych danych na poziomie pliku, organizując informacje poprzez foldery i ścieżki dostępu w formatach logicznych. Systemy te obsługują także aktualizacje lokalne i przechowywanie metadanych systemu plików. Firmy korzystają z rozwiązań do przechowywania plików w chmurze do tworzenia strukturalnych systemów plików opartych na chmurze, usprawniających zadania związane z zarządzaniem pamięcią masową. Chociaż narzędzia te są na ogół mniej skalowalne niż systemy przechowywania blokowego, oferują znaczne korzyści w upraszczaniu organizacji i struktury systemów informatycznych.