NCBI BLAST

NCBI BLAST to potężne narzędzie bioinformatyczne zaprojektowane do identyfikacji podobieństw między sekwencjami biologicznymi, takimi jak DNA, RNA i białka. Porównuje sekwencje zapytań z obszernymi bazami danych w celu znalezienia sekwencji homologicznych, pomagając w wnioskowaniu o powiązaniach funkcjonalnych i ewolucyjnych. Narzędzie oferuje różne wersje, w tym nukleotydową BLAST, Protein BLAST i BLASTx, która przed porównaniem tłumaczy sekwencje nukleotydowe na sekwencje białkowe.

Kluczowe cechy NCBI BLAST obejmują możliwość przeszukiwania wielu baz danych, takich jak bazy danych NCBI dotyczące nukleotydów i białek, a także ograniczanie przeszukiwania według cech organizmu lub sekwencji. Użytkownicy mogą wprowadzać sekwencje w formacie FASTA lub używać numerów dostępu do zapytań. Narzędzie obsługuje również zaawansowane funkcje, takie jak PSI-BLAST, który tworzy macierz punktacji dla konkretnej pozycji w celu uściślenia wyszukiwania.

NCBI BLAST jest szeroko stosowany w biologii molekularnej i bioinformatyce do zadań takich jak identyfikacja genów, analiza filogenetyczna i zrozumienie homologii sekwencji. Jego wszechstronne możliwości sprawiają, że jest to niezbędne źródło informacji dla badaczy pragnących analizować i rozumieć sekwencje biologiczne.