Podstawowe narzędzie do wyszukiwania lokalnych linii trasowania BLAST znajduje obszary podobieństwa między sekwencjami biologicznymi. Program porównuje sekwencje nukleotydów lub białek z bazami danych sekwencji i oblicza istotność statystyczną.

NCBI BLAST jest potężnym narzędziem bioinformatycznym zaprojektowanym do identyfikacji podobieństw między sekwencjami biologicznymi, takimi jak DNA, RNA i białka. Porównuje sekwencje zapytań z rozległymi bazami danych w celu znalezienia sekwencji homologicznych, pomagając w wnioskowaniu relacji funkcjonalnych i ewolucyjnych. Narzędzie oferuje różne wersje, w tym podmuch nukleotydowy, Blast Protein i Blastx, który przekłada sekwencje nukleotydowe na sekwencje białkowe przed porównanie.

Kluczowe funkcje NCBI BLAST obejmują możliwość wyszukiwania wielu baz danych, takich jak bazy danych nukleotydów NCBI i białko, a także ograniczyć wyszukiwanie przez organizm lub charakterystykę sekwencji. Użytkownicy mogą wprowadzać sekwencje w formacie FASTA lub używać numerów dostępu do zapytań. Narzędzie obsługuje również zaawansowane funkcje, takie jak PSI-Blast, która buduje macierz punktowania specyficzną dla pozycji, aby udoskonalić wyszukiwanie.

NCBI BLAST jest szeroko stosowany w biologii molekularnej i bioinformatyce do zadań takich jak identyfikacja genów, analiza filogenetyczna i zrozumienie homologii sekwencji. Jego solidne możliwości sprawiają, że jest to niezbędny zasób dla naukowców, którzy chcą analizować i zrozumieć sekwencje biologiczne.

Ten opis został wygenerowany przez AI (sztuczną inteligencję). AI może popełniać błędy. Sprawdź ważne informacje.

Strona internetowa: blast.ncbi.nlm.nih.gov

Zastrzeżenie: WebCatalog nie jest w żaden sposób powiązany, stowarzyszony, upoważniony ani wspierany przez twórców aplikacji NCBI BLAST. Wszelkie nazwy produktów, logotypy i marki należą do ich właścicieli.

NCBI BLAST

Zobacz także