Chrome に追加Tamarind Bioは、科学者が簡単なインターフェースで計算生物学ツールを利用できるウェブサイトとAPIです。主に構造生物学向けのツールを提供しています。
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Tamarindは、独自の高性能コンピューティング環境を構築・管理することなく、分子モデリングのワークフローを実行したい計算生物学者、タンパク質エンジニア、研究チーム向けのサービスです。ウェブインターフェースまたはAPIを通じて、公開されている計算生物学ツールにジョブを送信し、大規模にワークフローを実行できます。 Tamarindを使うと、配列からタンパク質の構造を予測したり、抗体やナノボディなどのタンパク質や結合分子を設計・最適化したり、分子間相互作用をモデル化したり、タンパク質や低分子をドッキングしたりできます。また、溶解性や熱安定性などの特性評価にもツールを活用できます。研究者は個別の解析を実行することも、入力データを一括処理することも、互換性のあるツールを連携させて複数段階のパイプラインを構築することもできます。
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