NCBI BLAST

NCBI Blast est un puissant outil de bioinformatique conçu pour identifier les similitudes entre les séquences biologiques, telles que l'ADN, l'ARN et les protéines. Il compare les séquences de requête à des bases de données étendues pour trouver des séquences homologues, en aidant dans l'inférence des relations fonctionnelles et évolutives. L'outil propose diverses versions, notamment Blast nucléotidique, Blast Protein et BLASTX, qui traduit des séquences nucléotidiques en séquences de protéines avant comparaison.

Les principales caractéristiques de NCBI Blast incluent la possibilité de rechercher dans plusieurs bases de données, telles que les bases de données nucléotidiques et protéiques NCBI, et de limiter les recherches par organisation ou caractéristiques de séquence. Les utilisateurs peuvent saisir des séquences au format FASTA ou utiliser des numéros d'accès pour les requêtes. L'outil prend également en charge des fonctionnalités avancées comme PSI-BLAST, qui construit une matrice de notation spécifique à la position pour affiner les recherches.

L'essai NCBI est largement utilisé en biologie moléculaire et en bioinformatique pour les tâches telles que l'identification des gènes, l'analyse phylogénétique et la compréhension de l'homologie des séquences. Ses capacités robustes en font une ressource essentielle pour les chercheurs qui cherchent à analyser et à comprendre les séquences biologiques.