NCBI BLAST

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NCBI Blast ist ein leistungsstarkes Bioinformatik -Tool, das Ähnlichkeiten zwischen biologischen Sequenzen wie DNA, RNA und Proteinen identifiziert. Es vergleicht Abfragesequenzen mit umfangreichen Datenbanken, um homologe Sequenzen zu finden, was die Inferenz von funktionalen und evolutionären Beziehungen unterstützt. Das Werkzeug bietet verschiedene Versionen, einschließlich Nucleotid -Explosion, Protein -Explosion und BLASTX, was Nucleotidsequenzen vor dem Vergleich in Proteinsequenzen übersetzt.

Zu den wichtigsten Merkmalen von NCBI Blast gehören die Fähigkeit, mit mehreren Datenbanken wie den NCBI -Nukleotid- und Proteindatenbanken zu suchen und die Suche nach Organismus oder Sequenzeigenschaften zu begrenzen. Benutzer können Sequenzen im Fasta -Format eingeben oder Zugangsnummern für Abfragen verwenden. Das Tool unterstützt auch erweiterte Funktionen wie PSI-Blast, die eine positionspezifische Bewertungsmatrix für die Verfeinerung der Suchanfragen erstellt.

Die NCBI -Explosion wird in der Molekularbiologie und Bioinformatik für Aufgaben wie Genidentifikation, phylogenetische Analyse und Verständnis der Sequenzhomologie häufig verwendet. Seine robusten Fähigkeiten machen es zu einer wesentlichen Ressource für Forscher, die biologische Sequenzen analysieren und verstehen wollen.

Grundlegendes Suchtool für lokale Ausrichtung BLAST findet Ähnlichkeitsbereiche zwischen biologischen Sequenzen. Das Programm vergleicht Nukleotid- oder Proteinsequenzen mit Sequenzdatenbanken und berechnet die statistische Signifikanz.

Website: blast.ncbi.nlm.nih.gov

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