Nonprofitorganisationer bruger CRM-software, der er specielt designet til at styre relationer med bestanddele som donorer, frivillige og medlemmer. Denne software hjælper med at tiltrække og fastholde personer, der er villige til at støtte organisationen, enten økonomisk eller gennem frivillig indsats. Typisk bruger nonprofit-medarbejdere, der er involveret i outreach, marketing, public relations eller fundraising, disse værktøjer. Ledere udnytter nonprofit-CRM til at vurdere effektiviteten af deres marketingstrategier og måle medlemsdeltagelse i forskellige aktiviteter, herunder begivenheder og fundraising-indsatser. Derudover integrerer denne software ofte med regnskabs- og betalingsløsninger for at overvåge donationer. Det er også afgørende for CRM at forbinde med andre nonprofit-værktøjer, såsom tilskudsadministration eller fundraising-platforme. Hvis salgs- og marketingfunktioner ikke er inkluderet i CRM, kan integration med yderligere løsninger være nødvendig.