NCBI BLAST

NCBI BLAST er et kraftfuldt bioinformatikværktøj designet til at identificere ligheder mellem biologiske sekvenser, såsom DNA, RNA og proteiner. Den sammenligner forespørgselssekvenser med omfattende databaser for at finde homologe sekvenser, hvilket hjælper med at konkludere funktionelle og evolutionære forhold. Værktøjet tilbyder forskellige versioner, herunder nukleotid BLAST, Protein BLAST og BLASTx, som oversætter nukleotidsekvenser til proteinsekvenser før sammenligning.

Nøglefunktioner ved NCBI BLAST inkluderer evnen til at søge mod flere databaser, såsom NCBI-nukleotid- og proteindatabaserne, og at begrænse søgninger efter organisme- eller sekvenskarakteristika. Brugere kan indtaste sekvenser i FASTA-format eller bruge adgangsnumre til forespørgsler. Værktøjet understøtter også avancerede funktioner som PSI-BLAST, som bygger en positionsspecifik scoringsmatrix for at forfine søgninger.

NCBI BLAST bruges i vid udstrækning inden for molekylærbiologi og bioinformatik til opgaver som genidentifikation, fylogenetisk analyse og forståelse af sekvenshomologi. Dens robuste egenskaber gør den til en vigtig ressource for forskere, der søger at analysere og forstå biologiske sekvenser.