NCBI BLAST

NCBI BLAST, DNA, RNA ve proteinler gibi biyolojik diziler arasındaki benzerlikleri tanımlamak için tasarlanmış güçlü bir biyoinformatik araçtır. Homolog dizileri bulmak için sorgu dizilerini kapsamlı veritabanlarıyla karşılaştırır ve işlevsel ve evrimsel ilişkilerin çıkarımına yardımcı olur. Araç, karşılaştırmadan önce nükleotid dizilerini protein dizilerine çeviren nükleotid BLAST, Protein BLAST ve BLASTx dahil olmak üzere çeşitli versiyonlar sunar.

NCBI BLAST'ın temel özellikleri arasında, NCBI nükleotid ve protein veritabanları gibi birden fazla veri tabanında arama yapma ve aramaları organizma veya dizi özelliklerine göre sınırlama yeteneği yer alır. Kullanıcılar FASTA formatında dizi girişi yapabilir veya sorgular için erişim numaralarını kullanabilir. Araç aynı zamanda aramaları hassaslaştırmak için konuma özel bir puanlama matrisi oluşturan PSI-BLAST gibi gelişmiş özellikleri de destekliyor.

NCBI BLAST, moleküler biyoloji ve biyoinformatikte gen tanımlama, filogenetik analiz ve dizi homolojisini anlama gibi görevlerde yaygın olarak kullanılmaktadır. Sağlam yetenekleri onu biyolojik dizileri analiz etmek ve anlamak isteyen araştırmacılar için önemli bir kaynak haline getiriyor.