NCBI BLAST

NCBI BLAST เป็นเครื่องมือชีวสารสนเทศที่ทรงพลังซึ่งออกแบบมาเพื่อระบุความคล้ายคลึงกันระหว่างลำดับทางชีววิทยา เช่น DNA, RNA และโปรตีน โดยจะเปรียบเทียบลำดับคิวรีกับฐานข้อมูลขนาดใหญ่เพื่อค้นหาลำดับที่คล้ายคลึงกัน ซึ่งช่วยในการอนุมานความสัมพันธ์เชิงฟังก์ชันและเชิงวิวัฒนาการ เครื่องมือเสนอรูปแบบต่างๆ ซึ่งรวมถึงนิวคลีโอไทด์ BLAST, โปรตีน BLAST และ BLASTx ซึ่งแปลลำดับนิวคลีโอไทด์ไปเป็นลำดับโปรตีนก่อนการเปรียบเทียบ

คุณสมบัติที่สำคัญของ NCBI BLAST ได้แก่ ความสามารถในการค้นหาฐานข้อมูลหลายฐานข้อมูล เช่น ฐานข้อมูลนิวคลีโอไทด์และโปรตีนของ NCBI และจำกัดการค้นหาตามลักษณะสิ่งมีชีวิตหรือลำดับ ผู้ใช้สามารถป้อนลำดับในรูปแบบ FASTA หรือใช้หมายเลขภาคยานุวัติสำหรับการสืบค้น เครื่องมือนี้ยังรองรับฟีเจอร์ขั้นสูง เช่น PSI-BLAST ซึ่งสร้างเมทริกซ์การให้คะแนนเฉพาะตำแหน่งเพื่อปรับแต่งการค้นหา

NCBI BLAST มีการใช้กันอย่างแพร่หลายในด้านอณูชีววิทยาและชีวสารสนเทศศาสตร์สำหรับงานต่างๆ เช่น การจำแนกยีน การวิเคราะห์สายวิวัฒนาการ และการทำความเข้าใจลำดับความคล้ายคลึงกัน ความสามารถที่แข็งแกร่งทำให้เป็นทรัพยากรที่จำเป็นสำหรับนักวิจัยที่ต้องการวิเคราะห์และทำความเข้าใจลำดับทางชีววิทยา