NCBI BLAST

NCBI BLAST är ett kraftfullt bioinformatikverktyg designat för att identifiera likheter mellan biologiska sekvenser, såsom DNA, RNA och proteiner. Den jämför frågesekvenser mot omfattande databaser för att hitta homologa sekvenser, vilket hjälper till att sluta sig till funktionella och evolutionära relationer. Verktyget erbjuder olika versioner, inklusive nukleotid BLAST, Protein BLAST och BLASTx, som översätter nukleotidsekvenser till proteinsekvenser innan jämförelse.

Nyckelfunktioner hos NCBI BLAST inkluderar möjligheten att söka mot flera databaser, såsom NCBIs nukleotid- och proteindatabaser, och att begränsa sökningar efter organism- eller sekvensegenskaper. Användare kan mata in sekvenser i FASTA-format eller använda åtkomstnummer för frågor. Verktyget stöder även avancerade funktioner som PSI-BLAST, som bygger en positionsspecifik poängmatris för att förfina sökningar.

NCBI BLAST används i stor utsträckning inom molekylärbiologi och bioinformatik för uppgifter som genidentifiering, fylogenetisk analys och förståelse av sekvenshomologi. Dess robusta kapacitet gör den till en viktig resurs för forskare som försöker analysera och förstå biologiska sekvenser.