NCBI BLAST

NCBI BLAST — мощный инструмент биоинформатики, предназначенный для выявления сходства между биологическими последовательностями, такими как ДНК, РНК и белки. Он сравнивает последовательности запросов с обширными базами данных, чтобы найти гомологичные последовательности, помогая сделать вывод о функциональных и эволюционных отношениях. Инструмент предлагает различные версии, в том числе нуклеотидные BLAST, Protein BLAST и BLASTx, которые перед сравнением переводят нуклеотидные последовательности в белковые последовательности.

Ключевые особенности NCBI BLAST включают возможность поиска в нескольких базах данных, таких как базы данных нуклеотидов и белков NCBI, а также ограничение поиска по характеристикам организма или последовательности. Пользователи могут вводить последовательности в формате FASTA или использовать инвентарные номера для запросов. Инструмент также поддерживает расширенные функции, такие как PSI-BLAST, который создает матрицу оценок для конкретной позиции для уточнения поиска.

NCBI BLAST широко используется в молекулярной биологии и биоинформатике для таких задач, как идентификация генов, филогенетический анализ и понимание гомологии последовательностей. Его широкие возможности делают его важным ресурсом для исследователей, стремящихся анализировать и понимать биологические последовательности.