NCBI BLAST

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O NCBI BLAST compara sequências biológicas como DNA e proteínas a bancos de dados, identificando semelhanças e inferindo relações funcionais e evolutivas.

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O NCBI BLAST é uma poderosa ferramenta de bioinformática projetada para identificar semelhanças entre sequências biológicas, como DNA, RNA e proteínas. Ele compara seqüências de consulta com bancos de dados extensos para encontrar sequências homólogas, ajudando na inferência de relações funcionais e evolutivas. A ferramenta oferece várias versões, incluindo explosão de nucleotídeos, explosão de proteínas e blastx, que traduz sequências de nucleotídeos para sequências de proteínas antes da comparação.

Os principais recursos da explosão do NCBI incluem a capacidade de pesquisar em vários bancos de dados, como os bancos de dados de nucleotídeos e proteínas do NCBI e limitar as pesquisas por características de organismo ou sequência. Os usuários podem inserir sequências no formato FASTA ou usar números de acesso para consultas. A ferramenta também suporta recursos avançados como o PSI-Blast, que cria uma matriz de pontuação específica para a posição para refinar as pesquisas.

A explosão do NCBI é amplamente utilizada em biologia molecular e bioinformática para tarefas como identificação de genes, análise filogenética e compreensão da homologia de sequência. Seus recursos robustos o tornam um recurso essencial para pesquisadores que buscam analisar e entender sequências biológicas.

Ferramenta básica de pesquisa de alinhamento local O BLAST encontra regiões de similaridade entre sequências biológicas. O programa compara sequências de nucleotídeos ou proteínas com bancos de dados de sequências e calcula a significância estatística.

Site: blast.ncbi.nlm.nih.gov

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