NCBI BLAST

NCBI BLAST er et kraftig bioinformatikkverktøy designet for å identifisere likheter mellom biologiske sekvenser, som DNA, RNA og proteiner. Den sammenligner spørringssekvenser mot omfattende databaser for å finne homologe sekvenser, noe som hjelper til med å konkludere med funksjonelle og evolusjonære forhold. Verktøyet tilbyr ulike versjoner, inkludert nukleotid BLAST, Protein BLAST og BLASTx, som oversetter nukleotidsekvenser til proteinsekvenser før sammenligning.

Nøkkelfunksjoner til NCBI BLAST inkluderer muligheten til å søke mot flere databaser, slik som NCBI-nukleotid- og proteindatabasene, og å begrense søk etter organisme- eller sekvensegenskaper. Brukere kan legge inn sekvenser i FASTA-format eller bruke tilgangsnumre for spørringer. Verktøyet støtter også avanserte funksjoner som PSI-BLAST, som bygger en posisjonsspesifikk scoringsmatrise for å avgrense søk.

NCBI BLAST er mye brukt i molekylærbiologi og bioinformatikk for oppgaver som genidentifikasjon, fylogenetisk analyse og forståelse av sekvenshomologi. Dens robuste evner gjør den til en viktig ressurs for forskere som ønsker å analysere og forstå biologiske sekvenser.