NCBI BLAST

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網站: blast.ncbi.nlm.nih.gov

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NCBI BLAST是一款生物信息學工具,用於比較生物序列,尋找核苷酸或蛋白質之間的相似性,以推斷功能和演化關係。
基本局部對齊搜尋工具 BLAST 發現生物序列之間的相似區域。該程式將核苷酸或蛋白質序列與序列資料庫進行比較並計算統計顯著性。

NCBI BLAST是一種強大的生物信息學工具,旨在識別生物學序列(例如DNA,RNA和蛋白質)之間的相似性。它比較了查詢序列與廣泛的數據庫,以找到同源序列,從而有助於推理功能和進化關係。該工具提供了各種版本,包括核苷酸爆炸,蛋白質BLAST和BLASTX,它們在比較之前將核苷酸序列轉化為蛋白質序列。

NCBI BLAST的關鍵特徵包括搜索多個數據庫(例如NCBI核苷酸和蛋白質數據庫)的能力,並限制了通過生物體或序列特徵進行搜索。用戶可以以FASTA格式輸入序列,也可以使用登錄號進行查詢。該工具還支持高級功能,例如PSI-Blast,該功能構建了特定位置的評分矩陣來完善搜索。

NCBI BLAST廣泛用於分子生物學和生物信息學用於基因鑑定,系統發育分析和理解序列同源性等任務。它的強大功能使其成為尋求分析和理解生物學序列的研究人員的重要資源。

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