Các tổ chức phi lợi nhuận sử dụng phần mềm CRM được thiết kế đặc biệt để quản lý mối quan hệ với các thành phần như nhà tài trợ, tình nguyện viên và thành viên. Phần mềm này hỗ trợ thu hút và giữ chân những cá nhân sẵn sàng hỗ trợ tổ chức, về mặt tài chính hoặc thông qua các nỗ lực tình nguyện. Thông thường, các nhân viên của tổ chức phi lợi nhuận tham gia tiếp cận cộng đồng, tiếp thị, quan hệ công chúng hoặc gây quỹ đều sử dụng những công cụ này. Các nhà quản lý tận dụng CRM phi lợi nhuận để đánh giá tính hiệu quả của các chiến lược tiếp thị của họ và đánh giá sự tham gia của thành viên vào các hoạt động khác nhau, bao gồm các sự kiện và nỗ lực gây quỹ. Ngoài ra, phần mềm này thường tích hợp với các giải pháp kế toán và thanh toán để theo dõi các khoản quyên góp. Điều quan trọng nữa là CRM phải kết nối với các công cụ phi lợi nhuận khác, chẳng hạn như nền tảng quản lý tài trợ hoặc gây quỹ. Nếu chức năng bán hàng và tiếp thị không được đưa vào CRM thì việc tích hợp với các giải pháp bổ sung có thể là cần thiết.