NCBI BLAST

NCBI BLAST is een krachtig bio-informatica-instrument dat is ontworpen om overeenkomsten tussen biologische sequenties, zoals DNA, RNA en eiwitten, te identificeren. Het vergelijkt zoeksequenties met uitgebreide databases om homologe sequenties te vinden, wat helpt bij het afleiden van functionele en evolutionaire relaties. De tool biedt verschillende versies, waaronder nucleotide BLAST, Protein BLAST en BLASTx, die nucleotidesequenties vóór vergelijking naar eiwitsequenties vertalen.

Belangrijke kenmerken van NCBI BLAST zijn onder meer de mogelijkheid om in meerdere databases te zoeken, zoals de NCBI-nucleotide- en eiwitdatabases, en om zoekopdrachten te beperken op organisme- of sequentiekenmerken. Gebruikers kunnen reeksen in FASTA-formaat invoeren of toegangsnummers gebruiken voor zoekopdrachten. De tool ondersteunt ook geavanceerde functies zoals PSI-BLAST, die een positiespecifieke scorematrix opbouwt om zoekopdrachten te verfijnen.

NCBI BLAST wordt veel gebruikt in de moleculaire biologie en bio-informatica voor taken zoals genidentificatie, fylogenetische analyse en het begrijpen van sequentiehomologie. De robuuste mogelijkheden maken het tot een essentiële hulpbron voor onderzoekers die biologische sequenties willen analyseren en begrijpen.