Şirketler üstlendikleri projelerin karlılığını takip etmek için proje maliyet yönetimi yazılımlarını kullanır. Bu yazılım, işletmelerin çeşitli projelerin maliyetlerini tahmin etmesine, fiili harcamaları izlemesine ve kar marjlarını belirlemek için bunları öngörülen maliyetlerle karşılaştırmasına yardımcı olur. Proje yöneticileri ve proje kontrol görevlileri, projelerin bütçe dahilinde kalmasını sağlamak için bu araca güveniyor. Muhasebeciler ayrıca bunu hem proje hem de portföy düzeyinde maliyetleri izlemek ve giderleri kaynak türüne (örneğin işçilik, malzeme) göre ayırmak için kullanırlar. Proje maliyet yönetimi yazılımı, daha geniş bir proje yönetimi veya proje ve portföy yönetimi paketinin parçası olarak sunulabilir. Genellikle entegre maliyet yönetimi araçlarına sahip olan proje bazlı ERP sistemlerine de dahil edilebilir. Bu çözümler ayrı olarak satıldığında proje, portföy ve program yönetimi yazılımı, ERP platformları ve muhasebe sistemleri dahil olmak üzere diğer sistemlerle entegre edilebilir.