非营利组织与企业的不同之处在于，非营利组织不以盈利为目的销售产品或服务。相反，他们的主要目标是为公众、其成员或特定社区服务。围绕免税组织的法规需要专门的会计软件。该非营利会计软件旨在管理各种资金来源，例如赠款、捐赠和会员捐款。它确保财务透明度，使捐助者能够了解其捐款的使用情况。此外，还需要提供具体报告以满足拨款申请的合规标准。
QuickBooks Online
QuickBooks Online 是一款云端会计和簿记应用，可用于管理收入和支出、发票、账单、银行交易、财务报表及税务记录，并支持多设备访问和协作。
Xero
Xero是一款基于云的会计软件，帮助小型企业和自由职业者管理财务，包括开票、费用跟踪和银行对帐等功能。
NetSuite
NetSuite是一个基于云的ERP平台，提供财务、库存、人力资源和客户关系管理等功能，适用于各类企业。
ChurchTrac
ChurchTrac是一款教会管理软件，提供会员管理、沟通、捐赠追踪、考勤、预算等功能，旨在简化教会的行政流程。
Sage Intacct
Sage Intacct是一个基于云的财务和会计平台，提供核心财务工具和实时报告，适用于各种行业的企业。
Aplos
Aplos 是一款云端财务管理软件，专为非营利和宗教组织设计，提供资金会计、捐赠管理、报告和活动管理功能。
Membership Toolkit
会员工具包为会员制组织提供成员目录、日历、活动与志愿者报名、表单、付款与筹款、商店和通知等管理与沟通功能，支持移动端访问与资料更新。
AccountsIQ
AccountsIQ是一款基于云的中型企业会计软件，简化多地业务的财务管理，支持自动化会计任务并提供集中报告功能。
Springly
Springly是一个集成的非营利组织管理软件，提供筹款、会计、网站建设及电子邮件等功能，帮助组织简化日常管理。
Araize FastFund
Araize FastFund 是基于云的非营利组织软件，整合基金会计、筹款（CRM）、薪资、合规与财务报表功能，支持网页访问。